MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 8495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018078	AGG	2	6	277829	277834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018078	TCG	2	6	281083	281088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018078	GCC	2	6	286805	286810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_018078	GCG	2	6	286818	286823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_018078	CTC	2	6	287018	287023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_018078	C	6	6	287082	287087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
507	NC_018078	TAGA	2	8	288330	288337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018078	GC	3	6	292002	292007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_018078	ACTT	2	8	292035	292042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_018078	GTA	2	6	292060	292065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018078	GCC	2	6	293483	293488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_018078	GGT	2	6	293506	293511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018078	GTT	2	6	293557	293562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018078	CCCCGA	2	12	293570	293581	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_018078	GCC	2	6	293611	293616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_018078	TGG	2	6	293619	293624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018078	GCG	2	6	293636	293641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_018078	TCGT	2	8	293661	293668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_018078	CCA	2	6	293680	293685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_018078	TCC	2	6	295579	295584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_018078	CCA	2	6	295641	295646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_018078	AT	3	6	295661	295666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018078	AACT	2	8	295711	295718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_018078	AACC	2	8	295719	295726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_018078	GCG	2	6	295770	295775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018078	GAA	2	6	295789	295794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018078	GGC	2	6	295809	295814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_018078	ATC	2	6	295832	295837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_018078	GC	3	6	295872	295877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_018078	ACA	2	6	296466	296471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_018078	ATG	2	6	296504	296509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018078	AGT	2	6	296533	296538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018078	GC	3	6	296585	296590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_018078	GAT	2	6	296610	296615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018078	GCC	2	6	296630	296635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_018078	CCG	2	6	296678	296683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_018078	ATGC	2	8	296709	296716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_018078	TCG	2	6	301622	301627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_018078	G	6	6	301659	301664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018078	GACG	2	8	302027	302034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
541	NC_018078	CGG	2	6	302070	302075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_018078	CGGCC	2	10	302082	302091	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
543	NC_018078	CA	3	6	302715	302720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_018078	GGA	2	6	305373	305378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018078	AGG	2	6	305382	305387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018078	GGC	2	6	306306	306311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_018078	CGG	2	6	309487	309492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_018078	CCG	2	6	309497	309502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_018078	GTC	2	6	309511	309516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_018078	AGC	2	6	309525	309530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_018078	CAG	2	6	309543	309548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_018078	GTG	3	9	309550	309558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018078	TTGC	2	8	309667	309674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_018078	GAA	2	6	309781	309786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018078	GGTC	2	8	309839	309846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
556	NC_018078	TGC	2	6	312645	312650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_018078	TTG	2	6	314154	314159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018078	GGC	2	6	314226	314231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_018078	AGCGG	2	10	314237	314246	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
560	NC_018078	GCT	2	6	315707	315712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_018078	TCC	2	6	315713	315718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_018078	TCGGC	2	10	316400	316409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
563	NC_018078	CG	4	8	317456	317463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_018078	GC	3	6	321181	321186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_018078	CGG	3	9	322668	322676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_018078	ATA	2	6	323245	323250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018078	CG	3	6	326194	326199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_018078	AAC	2	6	328451	328456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_018078	TTA	2	6	328468	328473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018078	AGATTC	2	12	330302	330313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
571	NC_018078	ATC	2	6	331602	331607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_018078	AGT	2	6	333322	333327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018078	GGT	2	6	333345	333350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018078	ATG	2	6	333355	333360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018078	AAG	2	6	336251	336256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018078	G	6	6	336282	336287	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018078	GGTA	2	8	336301	336308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018078	GCCG	2	8	336388	336395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_018078	TGGC	2	8	336400	336407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
580	NC_018078	CGG	2	6	336408	336413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_018078	AAG	2	6	339249	339254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018078	ACA	2	6	339271	339276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_018078	G	6	6	339280	339285	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018078	GT	3	6	339332	339337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018078	GCCG	2	8	339377	339384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_018078	TGGC	2	8	339389	339396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_018078	CGG	2	6	342005	342010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_018078	GCA	2	6	342104	342109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018078	GCG	2	6	342160	342165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_018078	GTG	2	6	342170	342175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018078	TCA	2	6	342202	342207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_018078	GTG	2	6	342215	342220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018078	GGTCGC	2	12	344927	344938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_018078	GA	3	6	354381	354386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018078	CTG	2	6	354692	354697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_018078	GAT	2	6	364106	364111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018078	GCG	2	6	366070	366075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_018078	TAG	2	6	366093	366098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018078	ATC	2	6	366672	366677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_018078	G	7	7	367356	367362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018078	CTGT	2	8	367374	367381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_018078	AATC	2	8	378644	378651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_018078	CTA	2	6	378654	378659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_018078	TCG	2	6	378770	378775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_018078	CTTGA	2	10	380776	380785	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
606	NC_018078	CGT	2	6	381520	381525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_018078	CGC	2	6	383389	383394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_018078	GTA	2	6	385344	385349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018078	GAG	2	6	385365	385370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018078	CGG	2	6	386448	386453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_018078	CAC	2	6	386454	386459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_018078	TCA	2	6	388850	388855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_018078	GCC	2	6	388877	388882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_018078	GCA	2	6	388902	388907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_018078	TCGCA	2	10	388946	388955	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
617	NC_018078	CGA	2	6	388989	388994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_018078	GGCC	2	8	389004	389011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_018078	GCC	2	6	389036	389041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_018078	AAGG	2	8	390020	390027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018078	CGG	2	6	390714	390719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_018078	TCT	2	6	390720	390725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_018078	TTC	2	6	390742	390747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_018078	GCG	2	6	391445	391450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_018078	TCG	2	6	391461	391466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_018078	AC	3	6	392134	392139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_018078	GGA	2	6	394151	394156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018078	GC	3	6	394162	394167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_018078	GCC	2	6	394177	394182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_018078	GGC	2	6	396932	396937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_018078	GAC	2	6	398210	398215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018078	ATA	2	6	398980	398985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018078	TGAC	2	8	398989	398996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_018078	GTCA	2	8	399000	399007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
635	NC_018078	GCG	2	6	399030	399035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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